Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Krt77Q6IFZ6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Krt77Q6IFZ6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Krt77Q6IFZ6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Krt77Q6IFZ6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Krt77Q6IFZ6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Krt77Q6IFZ6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Krt77Q6IFZ6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Krt77Q6IFZ6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms