Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms