Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm38Q62176 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rbm38Q62176 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rbm38Q62176 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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