Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhocQ62159 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhocQ62159 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhocQ62159 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms