Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms