Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ecm1Q61508 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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