Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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