Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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JrkQ60976 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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JrkQ60976 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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