Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprnQ60673 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms