Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms