Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp13a3Q5XF89 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms