Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Slc5a6Q5U4D8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms