Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme4Q5SSW2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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