Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrc43Q3V0L5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrc43Q3V0L5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrc43Q3V0L5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrc43Q3V0L5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Lrrc43Q3V0L5 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc43Q3V0L5 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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