Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28047Q3US59 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms