Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd27Q3UMR0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms