Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q3U595 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U595 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U595 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U595 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U595 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U595 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q3U595 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U595 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms