Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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