Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.8 ms