Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms