Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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