Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna5Q2MKA5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms