Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptcd3Q14C51 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms