Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms