Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms