Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cnn1Q08091 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnn1Q08091 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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