Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MestQ07646 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms