Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms