Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnb1Q03717 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms