Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scg2Q03517 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms