Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RykQ01887 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RykQ01887 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
RykQ01887 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RykQ01887 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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RykQ01887 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RykQ01887 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RykQ01887 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms