Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms