Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gabpb1Q00420 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gabpb1Q00420 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gabpb1Q00420 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Gabpb1Q00420 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gabpb1Q00420 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gabpb1Q00420 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gabpb1Q00420 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gabpb1Q00420 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gabpb1Q00420 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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