Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms