Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb1P70662 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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