Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Msx3P70354 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Msx3P70354 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Msx3P70354 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Msx3P70354 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Msx3P70354 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Msx3P70354 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Msx3P70354 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Msx3P70354 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Msx3P70354 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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