Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cux2P70298 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms