Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SbdsP70122 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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