Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms