Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms