Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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NcstnP57716 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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NcstnP57716 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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NcstnP57716 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NcstnP57716 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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