Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NcanP55066 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NcanP55066 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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NcanP55066 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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NcanP55066 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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NcanP55066 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcanP55066 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcanP55066 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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