Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad23aP54726 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms