Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Dbx1P52950 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Dbx1P52950 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms