Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tmod1P49813 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tmod1P49813 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmod1P49813 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms