Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rfx1P48377 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rfx1P48377 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rfx1P48377 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rfx1P48377 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rfx1P48377 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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