Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VdrP48281 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VdrP48281 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VdrP48281 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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