Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax9P47242 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms