Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms