Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtgfrP43117 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms